Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC4Q8WW27 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms