Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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TTC29Q8NA56 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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TTC29Q8NA56 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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TTC29Q8NA56 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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TTC29Q8NA56 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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TTC29Q8NA56 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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TTC29Q8NA56 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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TTC29Q8NA56 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TTC29Q8NA56 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
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