Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms