Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms