Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms