Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2H8

TMEM53, Transmembrane protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM53Q6P2H8 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM53Q6P2H8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM53Q6P2H8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM53Q6P2H8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM53Q6P2H8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM53Q6P2H8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM53Q6P2H8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM53Q6P2H8 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM53Q6P2H8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM53Q6P2H8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM53Q6P2H8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM53Q6P2H8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM53Q6P2H8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM53Q6P2H8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms