Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms