Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF8Q5VWM4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms