Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN4Q5MJ08 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms