Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMER1Q5JTC6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMER1Q5JTC6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMER1Q5JTC6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMER1Q5JTC6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMER1Q5JTC6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMER1Q5JTC6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms