Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA8Q53HL2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms