Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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SP6Q3SY56 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SP6Q3SY56 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SP6Q3SY56 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SP6Q3SY56 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SP6Q3SY56 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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