Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms