Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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KRTAP21-3Q3LHN1 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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