Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPY1Q3B7I2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNPY1Q3B7I2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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