Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LETM2Q2VYF4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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