Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRF1Q16656 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms