Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CTF1Q16619 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CTF1Q16619 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CTF1Q16619 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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CTF1Q16619 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CTF1Q16619 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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CTF1Q16619 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CTF1Q16619 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CTF1Q16619 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CTF1Q16619 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CTF1Q16619 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CTF1Q16619 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CTF1Q16619 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTF1Q16619 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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