Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ZNF56Q15929 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms