Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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