Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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