Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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BRD3Q15059 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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BRD3Q15059 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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BRD3Q15059 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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BRD3Q15059 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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BRD3Q15059 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BRD3Q15059 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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