Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAM2Q15035 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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