Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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LAPTM4AQ15012 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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LAPTM4AQ15012 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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LAPTM4AQ15012 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LAPTM4AQ15012 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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