Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCLAFQ15004 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms