Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.9 ms