Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NWD1Q149M9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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