Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOFQ13790 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOFQ13790 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOFQ13790 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOFQ13790 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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