Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDH18Q13634 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH18Q13634 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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