Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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PEX6Q13608 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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PEX6Q13608 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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PEX6Q13608 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PEX6Q13608 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PEX6Q13608 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PEX6Q13608 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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PEX6Q13608 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PEX6Q13608 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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