Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SP140Q13342 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP140Q13342 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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