Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RLFQ13129 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RLFQ13129 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RLFQ13129 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RLFQ13129 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RLFQ13129 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RLFQ13129 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
RLFQ13129 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RLFQ13129 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RLFQ13129 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RLFQ13129 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RLFQ13129 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RLFQ13129 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RLFQ13129 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RLFQ13129 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RLFQ13129 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RLFQ13129 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RLFQ13129 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RLFQ13129 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RLFQ13129 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RLFQ13129 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RLFQ13129 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RLFQ13129 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RLFQ13129 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RLFQ13129 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RLFQ13129 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RLFQ13129 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RLFQ13129 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RLFQ13129 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RLFQ13129 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RLFQ13129 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RLFQ13129 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RLFQ13129 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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