Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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