Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms