Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC173Q0VFZ6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms