Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CGNL1Q0VF96 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms