Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFFO1Q0D2I5 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms