Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms