Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms