Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LRP1Q07954 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms