Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GABPAQ06546 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms