Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC9Q06265 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms