Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms