Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTBN1Q01082 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms