Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP1Q00587 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP1Q00587 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms