Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK16Q00536 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms