Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VLDLRP98155 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms