Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX1P78337 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX1P78337 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX1P78337 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX1P78337 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX1P78337 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX1P78337 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX1P78337 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX1P78337 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PITX1P78337 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PITX1P78337 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PITX1P78337 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms