Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO4P61968 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms