Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARF3P61204 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF3P61204 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF3P61204 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF3P61204 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF3P61204 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF3P61204 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF3P61204 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF3P61204 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF3P61204 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARF3P61204 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms